試想一下,若沒(méi)有各種方法來(lái)分離組成細(xì)胞的不同區(qū)室和組分,那么現(xiàn)代生物學(xué)將困難重重。
從細(xì)胞信號(hào)通路 到新陳代謝,人們一直想知道,它們?cè)谀膬?,過(guò)去、現(xiàn)在及將來(lái)。賽默飛世爾科技 的市場(chǎng)部經(jīng)理Monica O'Hara Noonan介紹,研究人員對(duì)細(xì)胞進(jìn)行分級(jí)分離(fractionate)的原因有很多。
他們可能希望,當(dāng)感興趣的蛋白在某些條件下或某種處理之后轉(zhuǎn)位時(shí),對(duì)其進(jìn)行追蹤。對(duì)細(xì)胞進(jìn)行分級(jí)分離能增強(qiáng)低豐度蛋白的檢測(cè)能力,或降低下游分析或功能分析的復(fù)雜性。
如果您正在從事這一方面的研究,請(qǐng)繼續(xù)往下讀。從細(xì)胞 上講,我們會(huì)幫助您將小麥和谷殼分開(kāi)。
細(xì)胞的組分 如何對(duì)細(xì)胞進(jìn)行分級(jí)分離取決于很多因素,包括哪些儀器 、知識(shí)可以利用,您想要分離什么,以及這些組分的下游應(yīng)用是什么。離心是細(xì)胞分級(jí)分離中最常用的技術(shù)之一,它們單獨(dú)使用,或與其他方法結(jié)合。
例如,對(duì)于高爾基體 或過(guò)氧化物酶體,大部分操作都要求高速的密度梯度離心。然而,O'Hara Noonan也指出,超速離心也有一些缺點(diǎn),包括超速離心機(jī)是高價(jià)的儀器,有些實(shí)驗(yàn)室無(wú)法接觸到。
另外,密度梯度難以傾倒是出了名的,其結(jié)果是技術(shù)依賴(lài)的。當(dāng)然,其他的許多組分也可以只利用試劑和臺(tái)式儀器來(lái)富集。
供應(yīng)商開(kāi)發(fā)出一些試劑盒,能方便快捷地帶來(lái)高度富集的細(xì)胞組分。賽默飛世爾 全新設(shè)計(jì)的Mem-PER Plus試劑盒,能在一小時(shí)之內(nèi)富集完整的膜相關(guān)蛋白。
據(jù)sigma-aldrich 的產(chǎn)品專(zhuān)家Michael Moehlenbrock介紹,這類(lèi)試劑盒的原理在很大程度上是類(lèi)似的。它們往往使用低滲緩沖液給細(xì)胞膜帶來(lái)壓力,然后用等滲的提取緩沖液(帶或不帶還原劑和蛋白酶抑制劑)來(lái)維持感興趣的細(xì)胞器。
有時(shí)也需要機(jī)械裂解或去污劑裂解。“各個(gè)不同供應(yīng)商在細(xì)胞分級(jí)分離試劑盒的設(shè)計(jì)上都是一致的,而不同細(xì)胞組分的差異在于緩沖液組成、裂解試劑和離心速度,”Moehlenbrock說(shuō)。
此類(lèi)試劑盒的價(jià)值并不在于某些秘密試劑,而在于QC系統(tǒng)的一致性和重復(fù)性。“細(xì)胞分級(jí)分離的方法已經(jīng)過(guò)充分鑒定,其操作步驟適用于大部分應(yīng)用,”Moehlenbrock說(shuō)。
“商業(yè)化試劑盒為最終用戶帶來(lái)了簡(jiǎn)便和效率,同時(shí)提供了品質(zhì)保證的安全性?!?通過(guò)改變穿插在離心步驟之間的緩沖液的去污劑組分,研究人員可分離不止一個(gè)組分。
例如,市場(chǎng)上許多試劑盒可收集細(xì)胞核和胞漿蛋白。其他試劑盒也帶來(lái)了三個(gè)或四個(gè)不同的組分。
Cell Signaling Technology的Cell Fractionation Kit產(chǎn)生了細(xì)胞質(zhì)、細(xì)胞膜/細(xì)胞器以及細(xì)胞核/細(xì)胞骨架組分,而QIAGEN的Qproteome Cell Compartment Kit分離出細(xì)胞質(zhì)、細(xì)胞膜、細(xì)胞核和細(xì)胞骨架組分。美天旎提供一種不含去污劑的試劑盒,它利用TOM22抗體標(biāo)記的磁珠來(lái)特異分離線粒體。
據(jù)該公司的技術(shù)支持介紹,他們不提供其他亞細(xì)胞組分的產(chǎn)品,但客戶可以利用自己的抗體來(lái)間接分離其他組分。同樣地,賽默飛世爾的Cell Surface Protein Isolation Kit標(biāo)記細(xì)胞表面蛋白的外部賴(lài)氨酸,它具有一個(gè)可切割的生物素衍生物,讓此蛋白組分在細(xì)胞裂解后可被捕獲。
其中有什么 在細(xì)胞組分被分離出來(lái)之后,必須驗(yàn)證您的實(shí)驗(yàn),并確認(rèn)這些組分確實(shí)包含了您要分離的。盡管這些試劑盒通常不包含區(qū)分各種組分的試劑,但許多會(huì)指出不同的看家基因,讓您用來(lái)確保質(zhì)量。
Moehlenbrock表示:“在某些情況下,我們會(huì)提供分析的建議。”例如,Sigma-Aldrich Mitochondria Isolation Kit的技術(shù)指南建議檢查細(xì)胞色素c氧化酶活性和檸檬酸合酶活性,以確認(rèn)外膜和內(nèi)膜的完整性。
Cell Signaling Technology也提供Cell Fractionation Antibody Sampler Kit,作為分級(jí)分離試劑盒的伴隨產(chǎn)品。生產(chǎn)科學(xué)家Jim Cormier介紹,當(dāng)您在運(yùn)行Western時(shí),您會(huì)得到一個(gè)量化值,哪些組分占多少。
Sampler Kit包含細(xì)胞質(zhì)MEK1/2、線粒體凋亡誘導(dǎo)因子(AIF)、組蛋白H3和細(xì)胞骨架波形蛋白的兔單克隆抗體,以及山羊抗兔IgG。研究人員也可利用試劑盒中的建議,或搜索文獻(xiàn),組裝自己的Western blot或ELISA試劑盒。
不過(guò)Cormier也提醒,并非每個(gè)抗體都有著它應(yīng)有的特異性。下游的分析 與超速離心相比,基于試劑盒的細(xì)胞分級(jí)分離方法快速又方便,也適合多個(gè)下游應(yīng)用,如EMSA、報(bào)告基因分析、酶活分析和Western blot。
然而,制備過(guò)程中所使用的去污劑和鹽可能阻礙蛋白質(zhì)組學(xué)的應(yīng)用,如質(zhì)譜,“這有時(shí)取決于去污劑的量,去除的容易程度,以及是否用于功能分析,”O(jiān)'Hara Noonan說(shuō)?!霸谀承┣闆r下,您可能需要透析或脫鹽。”
同樣地,有時(shí)可能需要額外的步驟,來(lái)增加產(chǎn)物的純度。在讀研究生時(shí),Moehlenbrock一般使用臺(tái)式離心機(jī)來(lái)制備線粒體。
“有時(shí)我會(huì)用11,000 x g來(lái)去除細(xì)胞碎片。之后獲得線粒體提取物,并用蔗糖梯度和超速離心機(jī)來(lái)進(jìn)一步純化。
這取決于您想做什么,。
免疫磁珠法分離細(xì)胞原理:免疫磁珠法分離細(xì)胞是基于細(xì)胞表面抗原能與連接有磁珠的特異性單抗相結(jié)合,在外加磁場(chǎng)中,通過(guò)抗體與磁珠相連的細(xì)胞被吸附而滯留在磁場(chǎng)中,無(wú)該種表面抗原的細(xì)胞由于不能與連接著磁珠的特異性單抗結(jié)合而沒(méi)有磁性,不在磁場(chǎng)中停留,從而使細(xì)胞得以分離。
免疫磁珠法分為陽(yáng)性分離法和陰性分離法:陽(yáng)性分離法-磁珠結(jié)合的細(xì)胞就是所要分離獲得的細(xì)胞 陰性分離法-磁珠結(jié)合不需要的細(xì)胞,游離于磁場(chǎng)的細(xì)胞為所需細(xì)胞 一般而言,陰性分離法的磁珠用量比陽(yáng)性分離法的大,陽(yáng)性分離法用行更多。BD? Imag 磁珠:· 大小在0.1-0.45mm · 包被了BD Pharmingen生產(chǎn)的高質(zhì)量單抗 · 磁珠已為白細(xì)胞亞群的陽(yáng)性和陰性分離法所優(yōu)化 · 用于BD? IMagnet direct magnet 將包被了特異性單抗的BD IMag磁珠加入細(xì)胞懸液,磁珠特異性地與有相應(yīng)抗原的細(xì)胞亞群結(jié)合,通過(guò)BD? IMagnet direct magnet分離得到的連有BD IMag磁珠的細(xì)胞可直接用于功能試驗(yàn)和用流式細(xì)胞儀檢測(cè)。
缺點(diǎn):? 對(duì)細(xì)胞造成機(jī)械壓力,影響其生物學(xué)活性,不利于分離后培養(yǎng) ? 純度低 ? 容易阻塞FCM的噴嘴 BD IMag吸收大磁珠和小磁珠分離系統(tǒng)的優(yōu)點(diǎn),開(kāi)發(fā)出直徑約200nm中等大小磁珠。? 技術(shù)簡(jiǎn)單,分離在普通的試管中完成 ? 易于增大細(xì)胞用量 ? 對(duì)細(xì)胞溫和,不影響細(xì)胞功能及其分離后培養(yǎng),可直接上流式 ? 純度高,回收率高 ? 成本低 此外,Mouse lineage panel中biotin標(biāo)記的抗體還可用于FCM分析細(xì)胞表面抗原,以及進(jìn)行細(xì)胞/組織免疫熒光實(shí)驗(yàn)。
BD提供2種免疫磁珠:· 包被了針對(duì)白細(xì)胞亞群的單抗的磁珠 · 包被了鏈霉親和素(streptavidin)的磁珠:此種情況下,在實(shí)驗(yàn)系統(tǒng)中加入生物素標(biāo)記的單抗,磁珠通過(guò)streptavidin與生物素標(biāo)記的單抗結(jié)合,單抗與細(xì)胞表面相應(yīng)抗原特異性結(jié)合而使細(xì)胞被磁珠間接捕獲,從而達(dá)到分離。這種磁珠使研究者可根據(jù)自己需要選擇生物素標(biāo)記的各種單抗去分離目的細(xì)胞,應(yīng)用范圍更廣泛,使用更靈活。
不同物種磁珠分離試劑 人: CD3, CD4, CD8, CD14, CD19;小鼠: CD4, CD8a, CD14, CD45R/B220, CD90.2 (Thy1.2), CD11b, Ly-6G.? 利用Streptavidin連接的磁珠,只需選配biotin標(biāo)記的所需單抗,就能分離更多種類(lèi)細(xì)胞 新貨聚焦:現(xiàn)在,BD PMG又推出用于分離小鼠造血干細(xì)胞/祖細(xì)胞的新試劑mouse lineage panel。其中包括5種biotin標(biāo)記單抗,這些單抗能結(jié)合小鼠造血細(xì)胞的主要分化系細(xì)胞: T、B淋巴細(xì)胞,單核/巨噬細(xì)胞,粒細(xì)胞和紅細(xì)胞。
將這組試劑與Streptavidin Plus BD? IMag Particles (557812) 聯(lián)合使用,就能通過(guò)免疫磁性分離法去除小鼠骨髓造血細(xì)胞的主要分化系細(xì)胞,從而富集到造血干細(xì)胞和祖細(xì)胞(陰性片斷)。Mouse Lineage Panel(559971):(5*2ml/vial) 可分離109 Mouse骨髓細(xì)胞1) Biotin-anti-mouse CD3e (CD3 e chain);2) Biotin-anti-mouse CD11b;3) Biotin-anti-mouse CD45R/B220;4) Biotin-anti-mouse Ly-6G and Ly-6C (Gr-1);5) Biotin-anti-mouse TER-119/Erythroid Cells (Ly-76) 磁分離細(xì)胞的重要指標(biāo)是:純度和得率,這取決于磁珠所連接單抗的特異性和磁珠大小(磁性),然而太大的磁珠會(huì)影響細(xì)胞活性,也無(wú)法直接上流式。
目前市場(chǎng)上有2種磁性細(xì)胞分離系統(tǒng):* Small particles (≈50 nm) - MACS* Large particles (1200~4500 nm) -others(如Dynal) 小磁珠 優(yōu)點(diǎn):? 對(duì)細(xì)胞溫和,不影響分離細(xì)胞的后續(xù)培養(yǎng) ? 可直接上流式檢測(cè),不影響散射光 缺點(diǎn):? 需要很強(qiáng)的磁場(chǎng)來(lái)分離細(xì)胞 ? 分離速度很慢,得率不高 ? 需要一次性的分離柱,不能在普通試管進(jìn)行 ? 成本昂貴 大磁珠 ? 技術(shù)簡(jiǎn)單,分離可在試管中完成 ? 易于增減細(xì)胞用量 ? 速度快,得率高 ? 成本低。
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